Szczegóły publikacji

Opis bibliograficzny

EBIC: a scalable biclustering method for large scale data analysis / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 31–32. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3326762=2071089 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 32, Abstr. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania


Autorzy (2)


Słowa kluczowe

evolutionary computationgenetic programmingdata miningunsupervised machine learningbiclustering

Dane bibliometryczne

ID BaDAP124345
Data dodania do BaDAP2019-10-09
DOI10.1145/3319619.3326762
Rok publikacji2019
Typ publikacjimateriały konferencyjne (aut.)
Otwarty dostęptak
WydawcaAssociation for Computing Machinery (ACM)
KonferencjaGenetic and Evolutionary Computation Conference

Abstract

Biclustering is a technique that looks for patterns hidden in some columns and some rows of the input data. Evolutionary search-based biclustering (EBIC) is probably the first biclustering method that combines high accuracy of detection of multiple patterns with support for big data. EBIC has been recently extended to a multi-GPU method and allows to analyze very large datasets. In this short paper, we discuss the scalability of EBIC as well as its suitability for RNA-seq and single cell RNA-seq (scRNA-seq) experiments.

Publikacje, które mogą Cię zainteresować

fragment książki
EBIC: a next-generation evolutionary-based parallel biclustering method / Patryk Orzechowski, Moshe Sipper, Xiuzhen Huang, Jason H. Moore // W: GECCO 2018 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 27th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 23rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 15th–19th 2018, Kyoto, Japan. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2018. — Dod. ISBN: 978-1-4503-5764-7. — e-ISBN: 978-1-4503-5618-3. — S. 59–60. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/doi/pdf/10.1145/3205651.3208779?download=true [2020-01-14]. — Bibliogr. s. 60, Abstr. — P. Orzechowski – afiliacja: University of Pennsylvania
fragment książki
Strategies for improving performance of evolutionary biclustering algorithm EBIC / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 185–186. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3322046=2070965 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 186, Abstr. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania