Szczegóły publikacji

Opis bibliograficzny

Scalable biclustering – the future of big data exploration? / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO, Jason H. Moore // GigaScience [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2047-217X. — 2019 — vol. 8 iss. 7 art. no. giz078, s. 1–4. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 4, Abstr. — P. Orzechowski – dod. afiliacja: University of Pennsylvania


Autorzy (3)


Słowa kluczowe

data miningdisease subtype identificationco-clusteringgene-drug interactionbig databiclusteringbiomarker detectionparallel algorithmsprecision medicine

Dane bibliometryczne

ID BaDAP124284
Data dodania do BaDAP2019-09-23
Tekst źródłowyURL
DOI10.1093/gigascience/giz078
Rok publikacji2019
Typ publikacjiartykuł w czasopiśmie
Otwarty dostęptak
Creative Commons
Czasopismo/seriaGigaScience

Abstract

Biclustering is a technique of discovering local similarities within data. For many years the complexity of the methods and parallelization issues limited its application to big data problems. With the development of novel scalable methods, biclustering has finally started to close this gap. In this paper we discuss the caveats of biclustering and present its current challenges and guidelines for practitioners. We also try to explain why biclustering may soon become one of the standards for big data analytics.

Publikacje, które mogą Cię zainteresować

fragment książki
Mining a massive RNA-seq dataset with biclustering: are evolutionary approaches ready for big data? / Patryk ORZECHOWSKI, Jason H. Moore // W: GECCO 2019 [Dokument elektroniczny] : the Genetic and Evolutionary Computation Conference : a recombination of the 28th International Conference on Genetic Algorithms (ICGA) and the 24rd Annual Genetic Programming Conference (GP) : July 13th–17th 2019, Prague, Czech Republic. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — USA : ACM, cop. 2019. — e-ISBN: 978-1-4503-6748-6. — S. 304–305. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://dl.acm.org/ft_gateway.cfm?id=3321916=2071065 [2019-09-18]. — Bibliogr. s. 305, Abstr. — P. Orzechowski – dod. afilicja: University of Pennsylvania
artykuł
Rough assessment of GPU capabilities for parallel PCC-based biclustering method applied to microarray data sets / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2015 — vol. 11 iss. 4, s. 243–248. — Bibliogr. s. 247–248, Abstr. — Publikacja dostępna online od: 2015-12-02