Szczegóły publikacji

Opis bibliograficzny

Propagation-based biclustering algorithm for extracting inclusion-maximal motifs / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2016 — vol. 35 no. 2, s. 391–410. — Bibliogr. s. 408–410, Abstr.


Autorzy (2)


Słowa kluczowe

conserved gene expression motifsbiclusteringbioinformaticsmicroarray gene expression datadata miningpattern matching

Dane bibliometryczne

ID BaDAP104206
Data dodania do BaDAP2017-02-22
Rok publikacji2016
Typ publikacjiartykuł w czasopiśmie
Otwarty dostęptak
Czasopismo/seriaComputing and Informatics

Abstract

Biclustering, which is simultaneous clustering of columns and rows in data matrix, became an issue when classical clustering algorithms proved not to be good enough to detect similar expressions of genes under subset of conditions. Biclustering algorithms may be also applied to different datasets, such as medical, economical, social networks etc. In this article we explain the concept beneath hybrid biclustering algorithms and present details of propagation-based biclustering, a novel approach for extracting inclusion-maximal gene expression motifs conserved in gene microarray data. We prove that this approach may successfully compete with other well-recognized biclustering algorithms.

Publikacje, które mogą Cię zainteresować

fragment książki
Hybrid biclustering algorithms for data mining / Patryk ORZECHOWSKI, Krzysztof BORYCZKO // W: Applications of evolutionary computation : 19th European Conference, EvoApplications 2016 : Porto, Portugal, March 30–April 1, 2016 : proceedings, Pt. 1 / eds. Giovanni Squillero, Paolo Burelli. — Switzerland : Springer International Publishing, 2016. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 9597). — ISBN: 978-3-319-31203-3; e-ISBN: 978-3-319-31204-0. — S. 156–168. — Bibliogr. s. 166–168, Abstr. — Publikacja dostępna online od: 2016-03-15
fragment książki
Proximity measures and results validation in biclustering – a survey / Patryk ORZECHOWSKI // W: Artificial Intelligence and Soft Computing : 12th International Conference, ICAISC 2013 : Zakopane, Poland, June 9–13, 2013 : proceedings, Pt. 2 / eds. Leszek Rutkowski [et al.]. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2013. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; 7895. Lecture Notes in Artificial Intelligence). — ISBN: 978-3-642-38609-1; e-ISBN: 978-3-642-38610-7. — S. 206–217. — Bibliogr. S. 214–217, Abstr.